EcoBaleària
El medio ambiente es otro aspecto clave dentro de la política de sostenibilidad de la naviera. Con este programa, la Fundació Baleària impulsa su compromiso medioambiental creando valor con actividades que conciencien a preservar el medio y luchar contra el cambio climático y contra su degradación.Proyectos

Campamento Tortuga
Proyecto de colaboración para vigilar los nidos de tortugas marinas en la playa de las Albaranes de Dénia, en colaboración con el Ajuntament de Dénia, el Oceanogràfic de València, la Universitat de València y la Universitat Politècnica de València.
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BIODIBAL
Es un proyecto de colaboración con la Universitat de les Illes Balears, con el objeto de impulsar la generación y transferencia de conocimiento sobre la biodiversidad de las Islas Baleares.

Un Mar sin Plomos
Proyecto de colaboración con la Asociación OBESMAR (Observació i Estudi del Mar) que consiste en la recogida del plomo que va acumulándose en el litoral, procedente sobre todo de la pesca deportiva.
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Proyecto «Colisiones»
La Fundació Baleària colabora con el proyecto “COLISIONES” con la asociación TURSIOPS, entidad de investigación marina que tiene como misión el estudio de los cetáceos y sus amenazas en Baleares
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Los ferris, medios para estudiar los cetáceos del mediterráneo

Expedicionària
Es un proyecto de sensibilización y educación ambiental sobre la importancia de preservar el mar y minimizar el impacto ambiental de las actividades humanas en el transporte y el hogar. Este programa, dirigido a estudiantes de Secundaria, consiste en una expedición científica por el mar (a bordo de uno de los buques de Baleària) realizando avistamientos, y por tierra a través de actividades medioambientales.